Organik hayvan nakliyesi ve kesim kuralları aşağıda belirtilmiştir. a) Hayvanların nakliyesinde uyulması gereken kurallar; 1) Hayvanların nakilleri stressiz ve kısa zamanda gerçekleştirilecek şekilde yapılır. 2) Yükleme ve boşaltma işlemleri dikkatlice ve hayvanları zorlamak amacıyla elektriksel uyarıcı alet kullanılmadan gerçekleştirilmelidir. Nakliye öncesi ve esnasında herhangi bir yatıştırıcı ilaç kullanılamaz. 3) Kara taşımacılığında 8 saatte bir yemleme, sulama ve dinlendirme için mola verilir. 4) Yurt içi ve yurt dışı her türlü hayvan nakillerinde 3285 sayılı Hayvan Sağlığı ve Zabıtası Kanunu ve diğer ilgili mevzuat uygulanır. b) Kasaplık hayvanlara kesim esnasında stres yaratmayacak şekilde davranılır. Mümkün olan durumlarda ayrı mezbaha, kesimhane ve kombinalar kullanılır. Mümkün olmayan durumlarda ise konvansiyonel olarak yetiştirilmiş hayvanların kesiminden sonra, mezbaha, kesimhane ve kombinalar organik tarım yönetmeliğinin Ek-8’inde verilen maddeler ile temizlendikten sonra, organik hayvanların kesimi yapılır.