Mangan noksanlığı genellikle fazlaca organik madde içeren yüksek pH' lı, iyi havalanan, kurak ve yarı kurak bölgelerdeki alkali ve kireçli topraklarda daha sık görülmektedir. Genel olarak mangan noksanlığında genç yapraklarda kloroz ve bazen nekrozlar, tahıllarda buna ilave olarak gri benekler ortaya çıkmaktadır. Kloroz damarlar arasında ve mozaik benzeri şekillerde görülmektedir. Bitkilerde mangan noksanlığına neden olan faktörler aşağıda sıralanmıştır. - Topraktaki Mn+2 konsantrasyonu, - Topraktaki diğer katyonların konsantrasyonu, - Toprağın KDK' sı, - Toprağın organik madde içeriği, sıcaklığı, mikrobiyal aktivite, redoks potansiyeli, - Toprağın veya yetiştirme ortamının pH' sı gibi faktörler manganın yarayışlılığına etki etmektedirler.